宇宙世紀0096──在「夏亞之亂」三年後， 住在工業殖民衛星的平凡少年巴納吉．林克斯， 因為與神秘少女奧黛莉．伯恩的意外相逢， 而被捲入一連串圍繞著「拉普拉斯之盒」的事件。 這個隨著宇宙世紀開闢而誕生的「盒子」， 據稱一經開啟將導致聯邦政府終結……