天才外科醫師黑傑克，不但沒有醫師執照，且總是向患者索取高額手術費，使他在醫學界惡名昭彰，加上他的臉上有著因小時候发生意外而留下的巨大傷疤，大多數人都因害怕而對他退避三舍。

但他不在乎旁人的眼光，只按照自己的理念行事，經常做出看似不近人情，實則追求實質正義的舉動。例如：他一旦接受委托，一定傾全力救治病患，有時甚至賭上自己性命，也因此要求等價的回報。

盡管多數人不能諒解他的特立獨行，他仍堅定地走在自己所信仰的醫學之路上，在助手--小女孩皮諾可的陪伴下，追尋著生命的意義。